Термогенните фетбърнъри функционират на принципа на бързото загряване на тялото по време на физическа активност, което води до използване на енергията от мастните депа, а в следствие на това - до намаляване на мазнините. Термогенните фетбърнъри са смятани за най-ефективните фетбърнъри, за което свидетелства и фактът, че те могат да изгарят мазнини и без полагане на физически усилия, но редовните тренировки помагат за още по-бързо постигане на желания ефект. Едновременно с това увеличаването на температурата активно подпомага обмяната на веществата, тъй като при повишена температура метаболитните промени се извършват по-бързо.

Съставът на термогенните фетбърнъри е различен, но в повечето от тях можете да откриете синефрин, зелен чай или кафе, кофеин, L-карнитин или черен чай, които подпомагат активно изгарянето на мазнини и ускоряват метаболизма.